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Si está haciendo una presentación en JavaScript, hágalo en Javascript.Escribe tu presentación de diapositivas en HTML, dale estilo con CSS y contrólala con un poco de JavaScript con jQuery.Cuando haya terminado, Fathom.js incluso le permite sincronizar el video de su presentación de manera rápida y fácil.Fathom.js viene con mouse, teclado y barra de desplazamiento incorporados y proporciona una API simple para crear sus propias interfaces personalizadas.
Sitio web:
http://markdalgleish.com/projects/fathom/Categorias
Alternativas a Fathom.js para jQuery

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jmpress.js
jmpress.js es un complemento de jQuery para construir un sitio web en el lienzo infinito.

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scrolldeck
Un complemento de jQuery para crear presentaciones de desplazamiento. Por ejemplo: animaciones, imágenes de pantalla completa o paralaje.