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DNAssist
DNAssist proporciona una interfaz única e intuitiva dentro de la cual se muestran, editan y analizan los archivos de secuencia.El usuario puede personalizar la pantalla en las ventanas del editor seleccionando la fuente, el tamaño de fuente y la longitud de la línea.Una secuencia se analiza simplemente colocando una ventana del editor en la parte superior y seleccionando el análisis requerido en el menú.Todos los análisis también se pueden realizar en una región seleccionada de la secuencia en una ventana del editor.Al hacer clic con el botón derecho del mouse, aparecerá un menú emergente sensible al contexto.Esto le da al usuario un acceso directo conveniente a la mayoría de los elementos del menú.Los análisis disponibles en DNAssist incluyen: La conversión de una secuencia de ADN entre las formas circulares y lineales La conversión de ADN en un ARN o una secuencia de proteínas La conversión de ARN en un ADN o una secuencia de proteínas Traducir una secuencia de ADN a la secuencia de aminoácidosen uno, tres o los seis cuadros Localización de marcos de lectura abiertos (ORF) en una secuencia de ADN Ubicación de patrones de secuencia específicos en una secuencia (esto permite comodines, desajustes y lagunas) Realización de un análisis de enzimas de restricción con un conjunto definido de enzimas Realización de un promotor de ADNanálisis con factores de transcripción especificados Localización de señales de posicionamiento de nucleosomas fuertes en el ADN Realización de múltiples alineaciones de ADN, ARN o proteínas Obtención del peso molecular de un ácido nucleico o proteína Obtención de la temperatura de fusión de un oligonucleótido Cálculo del pI de una proteína Cálculo de la cantidad hidrofílica, hidrófoba oPerfil antigénico de una proteína Obtención del coeficiente de absorción molar y E0.1% de un aci nucleicodo una proteína La obtención de la composición de nucleótidos o aminoácidos de un ácido nucleico o proteína DNAssist reúne todas estas características en una aplicación de Windows estrechamente integrada.El resultado de un análisis se muestra en una ventana de resultados y se puede imprimir, guardar en disco o copiar y pegar en aplicaciones de terceros.Los resultados guardados o copiados conservan el formato en el que se mostraron ...
dnassist
Sitio web:
https://github.com/mcychan/DNAssist/wikiCategorias
Alternativas a DNAssist para todas las plataformas con cualquier licencia
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Genome Compiler
Genome Compiler es una plataforma de diseño genético fácil de usar que permite a los investigadores manipular y diseñar todo, desde genes individuales hasta genomas completos.