Cytoscape es una plataforma de software de código abierto para visualizar redes complejas e integrarlas con cualquier tipo de datos de atributos.Hay muchos complementos disponibles para varios tipos de dominios problemáticos, incluyendo bioinformática, análisis de redes sociales y web semántica.Cytoscape admite muchos casos de uso en biología molecular y de sistemas, genómica y proteómica: Cargue conjuntos de datos de interacción molecular y genética en muchos formatos. Proyecte e integre conjuntos de datos globales y anotaciones funcionales. Establezca mapas visuales potentes a través de estos datos.y analizar conjuntos de datos de vías curadas por humanos como Reactome o KEGG.