BioBlender es un paquete de software basado en el software de modelado 3D de código abierto.La biología funciona a nanoescala, con objetos invisibles para el ojo humano.Con BioBlender es posible mostrar algunos de los caracteres que pueblan nuestras células, en base a datos científicos y al más alto nivel de manipulación 3D.Científicos de todo el mundo estudian proteínas a nivel atómico y depositan información en el repositorio público Protein Data Bank, donde cada molécula se describe como la lista de sus átomos y sus coordenadas 3D ... Con BioBlender, los usuarios pueden manejar proteínas en el espacio 3D, mostrando su superficie de una manera fotorrealista y elaborando movimientos de proteínas sobre la base de conformaciones conocidas.Los archivos PDB pueden cargarse desde un directorio definido por el usuario o descargarse directamente del sitio PDB (insertando el código PDB).La proteína se muestra en 3D (como átomos o superficie molecular) y el usuario puede calcular y visualizar sus propiedades superficiales, potencial lipofílico molecular y potencial electrostático.Para el movimiento de proteínas, BioBlender calcula intermedios entre dos conformaciones usando Blender Game Engine.El programa proporciona como salida los archivos PDB intermedios y las imágenes renderizadas como una película.BioBlender es una implementación de Blender, un programa de código abierto, distribuido libremente, multiplataforma, interoperable y compatible de animación 3D, efectos visuales y videojuegos.La combinación de gráficos 3D por computadora, motor de juegos y programas científicos hacen de BioBlender un instrumento completo para elaborar el movimiento de proteínas y mostrar sus características de superficie utilizando un código visual basado en texturas y efectos especiales de partículas.De esta manera, es posible mostrar las propiedades físicas y químicas de una molécula en movimiento.BioBlender es el resultado de una colaboración, impulsada por el grupo SciVis en el CNR en Pisa (Italia), entre científicos de diferentes disciplinas (biología, química, física, ciencias de la computación) y