AtomEye es un software de visualización atomística lo suficientemente rápido como para manejar la salida de simulaciones de dinámica molecular con millones de átomos.Incluye proyecciones paralelas y en perspectiva con navegación tridimensional completa, cálculo de número de enlace y coordinación personalizable, codificación de color de cantidades arbitrarias definidas por el usuario, invariante de deformación atómica local, mosaico y trazado de átomos coloreados, hasta 16 planos de corte, condición de límite periódicatraducciones, capturas de pantalla JPEG, PNG y EPS, y secuencias de comandos de animación ...