JMicroVision ha sido diseñado para describir, medir, cuantificar y clasificar componentes de todo tipo de imágenes.Tiene una interfaz de usuario intuitiva con potentes funciones y admite imágenes muy grandes.JMicroVision contiene herramientas con diferentes grados de automatización para gestionar imágenes complejas y variadas.Al igual que un microscopio, permite una observación dinámica de una muestra con la posibilidad de combinar varios enfoques o modos de iluminación (luz polarizada, fluorescencia ...).Además, la lente de aumento y la herramienta de vista múltiple permiten una vista simultánea de varias imágenes, cada una con su propio coeficiente de zoom y manteniendo una posición común en el centro.